任何清洗系統都不能少了清洗劑的輔助，在購買清洗系統之前，應對被清洗件做如下應用分析：明確被洗件的材料構成、結構和數量，分析并明確要清除的污物，這些都是決定所要使用什么樣的清洗方法，判斷應用水性清洗劑還是用溶劑的先決條件。終端的清洗工藝還需做清洗實驗來驗證。只有這樣，才能提供合適的清洗系統、設計合理的清洗工序以及清洗劑。

考慮到清洗劑的物理特性對超聲清洗的影響，其中蒸汽壓、表面張力、黏度以及密度應為顯著的影響因素。溫度能影響這些因素，所以它也會影響空化作用的效率。

擇清洗劑時，應考慮以下三個因素：

1.清洗效率：選擇有效的清洗溶劑時，一定要做實驗。如在現有的清洗工藝中引入超聲，所使用的溶劑一般不必變更;

2.操作簡單：所使用的液體應安全無毒、操作簡單且使用壽命長;

3.成本：廉價的清洗溶劑的使用成本并不一定低。使用中須考慮到溶劑的清洗效率、安全性、一定量的溶劑可清洗多少工件利用率高等因素。當然，所選擇的清洗溶劑須達到清洗效果，并應與所清洗的工件材料相容。水為普通的清洗劑，故使用水基溶液的系統操作簡便、使用成本低、應用廣泛。然而對某些材料以及污垢等并不適用于水性溶液，那么還有許多溶劑可供選用。不同的清洗劑，要區分的清洗系統水性系統：通常由敞口槽組成，工件浸沒其中。而復雜的系統由多個槽組成，并配備循環過濾系統、沖淋槽、干燥槽以及其它附件。