超聲波清洗機如果使用不當，會影響正常工作，影響清洗效果。為保證超聲波清洗機的實際使用效果，可根據超聲波清洗機的功率密度、超聲頻率機的清洗時間、溫度等因素對其實際使用效果進行分析。清洗機溫度越高，對污垢分解越有利，但溫度達到一定范圍后，會影響超聲作用，降低清洗機的清潔效果。

清洗機的清洗時間需要根據產品的不同進行設置，另外，除了特殊材料外，清洗劑及污垢的種類，使用高功率密度處理較難的零件，使用低功率密度精密零件，頻率汽化程度較低，頻率偏移效應較大，對于簡單表面、復雜表面及深孔，在工作時必須使用高頻超聲波清洗機，以產生紊流聲，并可方便地加入清洗劑清除。

超聲波清洗機工作時，應盡量避免溫度升高，以防止設備正常運轉，要注意清洗劑的安全，嚴禁超聲波清洗機內其它異常物品掉落，最后，要經常保養和維護超聲波清洗機，因為建議應立即清除罐底異物，更換或倒出清洗液，必須在常溫下進行機器保養和清洗用品。

超聲波清洗機正常工作時，應聽到超聲與水箱均勻的聲音，不得攪動清洗液的表面，只應在清洗孔產生的噴水，在保證清洗物干凈的前提下，盡量不要加熱和間歇工作，因為加熱和長時間的超聲會提高水箱的溫度。